phosphatase and tensin homolog [Source:HGNC Symbol;Acc:9588]
10
89622870
89731687
1
q23.31
89622870
89731687
PTEN
PTEN-001
HGNC Symbol
HGNC transcript name
5
35.77
protein_coding
protein_coding
ensembl_hava
ensembl_hava
KNOWN
KNOWN
5728
9588
PTEN
NM_000314
27525
MSeqDR Master Exome Data Set M1: 114 entries from same gene
No.
Chr
Position
Reference
Variant
EnsemblTranscriptID
EnsemblGeneID
Gene_Start
Gene_End
EnsemblProteinID
Gene
strand
Uniprot
cChange
pChange
Nature
dbSNP
Freq
EVS
phastCons
SIFT
Polyphen
HGMD
type
samples
1
10
89622875
C
T
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
NA
-
-
-
-
-
-
het
3
2
10
89623002
C
T
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
NA
-
-
-
-
-
-
het
2
3
10
89623056
C
T
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
NA
-
-
-
-
-
-
het
1
4
10
89623084
C
T
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
NA
-
-
-
-
-
-
het
1
5
10
89623200
C
A
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
rs34149102
-
-
-
-
-
-
het
5
6
10
89623251
G
A
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
NA
-
-
-
-
-
-
het
4
7
10
89623251
G
C
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
NA
-
-
-
-
-
-
het
2
8
10
89623323
G
A
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
rs1044322
0.0108
-
lod=160:512
-
-
-
hom
3
9
10
89623323
G
A
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
rs1044322
0.0108
-
lod=160:512
-
-
-
het
34
10
10
89623332
T
C
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
NA
-
-
lod=160:512
-
-
-
het
1
11
10
89623376
C
T
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
NA
-
-
lod=432:618
-
-
-
het
1
12
10
89623392
C
T
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
NA
-
-
lod=432:618
-
-
HGMD
het
1
13
10
89623581
C
T
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
NA
-
-
lod=432:618
-
-
-
het
4
14
10
89623581
C
T
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
NA
-
-
lod=432:618
-
-
-
hom
1
15
10
89623636
G
A
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
rs35736544
-
-
-
-
-
-
het
1
16
10
89623678
C
+GCG
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
NA
-
-
lod=1183:725
-
-
-
het
23
17
10
89623716
G
A
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
rs12573787
0.2033
-
lod=1183:725
-
-
-
het
146
18
10
89623716
G
A
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
rs12573787
0.2033
-
lod=1183:725
-
-
-
hom
11
19
10
89623832
A
G
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
NA
-
-
lod=1183:725
-
-
-
het
2
20
10
89623860
C
-T
ENST00000371953
ENSG00000171862
89622870
89731687
ENSP00000361021
PTEN
1
PTEN_HUMAN
-
-
5'_UTR
rs71022512
-
-
lod=1183:725
-
-
-
het
3
** A friendly reminder: guest user can access up to first 20 entries per gene from MSeqDR Master Exome Data Set M1. To gain access to the full power of MSeqDR, please login, or register, then request access to data.
As MSeqDR registered user , your accessible protected data set after login: